Evaluación computacional de las interacciones de compuestos naturales y el dominio unión al ARN de las nucleolinas utilizando acoplamiento molecular y simulaciones de dinámica molecular

Varios estudios proponen la nucleolina como un blanco alternativo para búsqueda y el diseño de nuevas terapias antitumorales o anticancerígenas. El objetivo este estudio fue evaluar compuestos con potenciales afinidades unión al ARN las nucleolinas mediante herramientas bioinformáticas. Se evaluaron diez los cuales tres moléculas (ácido betulínico, triptolide berberina) presentaron interacción dominio (RNA binding domain, RBD), exhibiendo valores energía significativamente favorables (p<0,05) una constante disociación calculada (Kd calc) entre 0,14 0,91 μM. Las simulaciones dinámica molecular evidenciaron que únicamente complejo nucleolina-berberina tuvo estabilidad libre favorable en tiempo simulado. Los residuos involucrados formación del eran aminoácidos cumplen funciones importantes sitio activo. hallazgos sugieren que, evaluados, berberina resultados potencial inhibidor actividades nucleolina, específicamente RBD.